MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 plasmid pEC4115

Total Repeats: 709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011351	ATG	2	6	90	95	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395651
2	NC_011351	TCAA	2	8	137	144	50 %	25 %	0 %	25 %	209395651
3	NC_011351	TGA	2	6	179	184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395651
4	NC_011351	ACA	2	6	255	260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209395651
5	NC_011351	TTG	2	6	268	273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395651
6	NC_011351	GAA	2	6	380	385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395651
7	NC_011351	AAG	2	6	392	397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395651
8	NC_011351	GAA	2	6	438	443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395651
9	NC_011351	T	6	6	463	468	0 %	100 %	0 %	0 %	209395651
10	NC_011351	CTC	2	6	550	555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209395651
11	NC_011351	AT	3	6	567	572	50 %	50 %	0 %	0 %	209395651
12	NC_011351	AAAT	2	8	736	743	75 %	25 %	0 %	0 %	209395651
13	NC_011351	TCA	2	6	744	749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395651
14	NC_011351	GTT	2	6	762	767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395651
15	NC_011351	TGAA	2	8	769	776	50 %	25 %	25 %	0 %	209395651
16	NC_011351	ATC	2	6	829	834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395651
17	NC_011351	GGC	2	6	862	867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209395651
18	NC_011351	ATA	2	6	939	944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395651
19	NC_011351	TAG	2	6	1015	1020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395651
20	NC_011351	TAT	2	6	1023	1028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395651
21	NC_011351	GGA	2	6	1040	1045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209395651
22	NC_011351	AAAG	2	8	1077	1084	75 %	0 %	25 %	0 %	209395651
23	NC_011351	ATG	2	6	1100	1105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395651
24	NC_011351	AC	3	6	1244	1249	50 %	0 %	0 %	50 %	209395646
25	NC_011351	AGCG	2	8	1351	1358	25 %	0 %	50 %	25 %	209395646
26	NC_011351	A	8	8	1384	1391	100 %	0 %	0 %	0 %	209395646
27	NC_011351	AGCT	2	8	1407	1414	25 %	25 %	25 %	25 %	209395646
28	NC_011351	TCT	2	6	1449	1454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209395646
29	NC_011351	ACT	2	6	1495	1500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395646
30	NC_011351	CTTT	2	8	1637	1644	0 %	75 %	0 %	25 %	209395678
31	NC_011351	AAT	2	6	1663	1668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395678
32	NC_011351	GTT	2	6	1731	1736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395678
33	NC_011351	A	7	7	1770	1776	100 %	0 %	0 %	0 %	209395678
34	NC_011351	ATG	2	6	1818	1823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395682
35	NC_011351	ACT	2	6	1880	1885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395682
36	NC_011351	GTT	2	6	1936	1941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395682
37	NC_011351	CTT	2	6	1979	1984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209395682
38	NC_011351	GAA	2	6	1985	1990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395682
39	NC_011351	TGA	2	6	2005	2010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395682
40	NC_011351	A	6	6	2010	2015	100 %	0 %	0 %	0 %	209395682
41	NC_011351	AAT	2	6	2029	2034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395682
42	NC_011351	TATG	2	8	2208	2215	25 %	50 %	25 %	0 %	209395687
43	NC_011351	AAG	2	6	2220	2225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395687
44	NC_011351	AG	4	8	2255	2262	50 %	0 %	50 %	0 %	209395687
45	NC_011351	A	6	6	2282	2287	100 %	0 %	0 %	0 %	209395687
46	NC_011351	TTAT	2	8	2321	2328	25 %	75 %	0 %	0 %	209395687
47	NC_011351	CTTTT	2	10	2361	2370	0 %	80 %	0 %	20 %	209395687
48	NC_011351	GATGA	2	10	2430	2439	40 %	20 %	40 %	0 %	209395687
49	NC_011351	AATAT	2	10	2477	2486	60 %	40 %	0 %	0 %	209395686
50	NC_011351	ACA	2	6	2507	2512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209395686
51	NC_011351	GCA	2	6	2540	2545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209395686
52	NC_011351	T	6	6	2573	2578	0 %	100 %	0 %	0 %	209395686
53	NC_011351	TAT	2	6	2596	2601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395686
54	NC_011351	TTG	2	6	2604	2609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395686
55	NC_011351	ATA	2	6	2618	2623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395686
56	NC_011351	TGGT	2	8	2682	2689	0 %	50 %	50 %	0 %	209395686
57	NC_011351	ATT	2	6	2712	2717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395686
58	NC_011351	TCT	2	6	2762	2767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209395686
59	NC_011351	AGG	2	6	2929	2934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209395686
60	NC_011351	T	6	6	2946	2951	0 %	100 %	0 %	0 %	209395686
61	NC_011351	TAC	2	6	2953	2958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395686
62	NC_011351	GGTA	2	8	3004	3011	25 %	25 %	50 %	0 %	209395686
63	NC_011351	TTTA	2	8	3013	3020	25 %	75 %	0 %	0 %	209395686
64	NC_011351	GTT	2	6	3075	3080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395686
65	NC_011351	ACA	2	6	3142	3147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209395686
66	NC_011351	TTA	2	6	3197	3202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395686
67	NC_011351	GCA	2	6	3308	3313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209395686
68	NC_011351	GCT	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209395686
69	NC_011351	A	6	6	3386	3391	100 %	0 %	0 %	0 %	209395686
70	NC_011351	AGT	2	6	3403	3408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395686
71	NC_011351	AGG	2	6	3442	3447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209395686
72	NC_011351	A	6	6	3456	3461	100 %	0 %	0 %	0 %	209395663
73	NC_011351	GTT	2	6	3462	3467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395663
74	NC_011351	TC	3	6	3494	3499	0 %	50 %	0 %	50 %	209395663
75	NC_011351	ATG	2	6	3520	3525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395663
76	NC_011351	ATT	3	9	3529	3537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395663
77	NC_011351	A	6	6	3557	3562	100 %	0 %	0 %	0 %	209395663
78	NC_011351	AGA	2	6	3644	3649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395663
79	NC_011351	AAT	2	6	3673	3678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395663
80	NC_011351	TGT	2	6	3748	3753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395666
81	NC_011351	GCT	2	6	3809	3814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209395666
82	NC_011351	ACA	2	6	3823	3828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209395666
83	NC_011351	A	7	7	3873	3879	100 %	0 %	0 %	0 %	209395666
84	NC_011351	TAG	2	6	3904	3909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395666
85	NC_011351	GAAA	2	8	3993	4000	75 %	0 %	25 %	0 %	209395666
86	NC_011351	ATG	2	6	4041	4046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395666
87	NC_011351	AAAT	2	8	4059	4066	75 %	25 %	0 %	0 %	209395666
88	NC_011351	GCGG	2	8	4099	4106	0 %	0 %	75 %	25 %	209395666
89	NC_011351	ATT	2	6	4129	4134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395666
90	NC_011351	CGC	2	6	4149	4154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209395666
91	NC_011351	A	6	6	4191	4196	100 %	0 %	0 %	0 %	209395666
92	NC_011351	TGA	2	6	4252	4257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395666
93	NC_011351	GCTA	2	8	4406	4413	25 %	25 %	25 %	25 %	209395685
94	NC_011351	TCT	2	6	4479	4484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209395685
95	NC_011351	A	7	7	4536	4542	100 %	0 %	0 %	0 %	209395685
96	NC_011351	AT	3	6	4614	4619	50 %	50 %	0 %	0 %	209395685
97	NC_011351	CTG	2	6	4648	4653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209395685
98	NC_011351	A	6	6	4706	4711	100 %	0 %	0 %	0 %	209395685
99	NC_011351	A	6	6	4722	4727	100 %	0 %	0 %	0 %	209395685
100	NC_011351	GGA	2	6	4728	4733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209395685
101	NC_011351	TAT	2	6	4770	4775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395685
102	NC_011351	AAGA	2	8	4800	4807	75 %	0 %	25 %	0 %	209395685
103	NC_011351	TAA	2	6	4817	4822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395685
104	NC_011351	GAA	2	6	4847	4852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395685
105	NC_011351	TGT	2	6	4859	4864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395685
106	NC_011351	CAA	2	6	4903	4908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209395685
107	NC_011351	ATT	2	6	4981	4986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395685
108	NC_011351	GAAT	2	8	4988	4995	50 %	25 %	25 %	0 %	209395685
109	NC_011351	GTTTT	2	10	5015	5024	0 %	80 %	20 %	0 %	209395655
110	NC_011351	ATT	2	6	5028	5033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395655
111	NC_011351	TGCGGC	2	12	5055	5066	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	209395655
112	NC_011351	CTA	2	6	5084	5089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395655
113	NC_011351	TTG	2	6	5126	5131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395655
114	NC_011351	G	6	6	5195	5200	0 %	0 %	100 %	0 %	209395655
115	NC_011351	AGT	2	6	5244	5249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395655
116	NC_011351	CGG	2	6	5250	5255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209395655
117	NC_011351	TAA	2	6	5281	5286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395655
118	NC_011351	ATG	2	6	5338	5343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395642
119	NC_011351	GTC	2	6	5365	5370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209395642
120	NC_011351	TTTC	2	8	5371	5378	0 %	75 %	0 %	25 %	209395642
121	NC_011351	GAT	2	6	5403	5408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395642
122	NC_011351	T	7	7	5429	5435	0 %	100 %	0 %	0 %	209395642
123	NC_011351	TGG	2	6	5460	5465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209395642
124	NC_011351	CTT	2	6	5520	5525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209395642
125	NC_011351	CAT	2	6	5544	5549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395642
126	NC_011351	ATT	2	6	5632	5637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395642
127	NC_011351	GTT	2	6	5748	5753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395648
128	NC_011351	TTCTT	2	10	5822	5831	0 %	80 %	0 %	20 %	209395648
129	NC_011351	AAG	2	6	5878	5883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395648
130	NC_011351	AGA	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395648
131	NC_011351	TGA	2	6	5930	5935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395648
132	NC_011351	ATTT	2	8	5965	5972	25 %	75 %	0 %	0 %	209395648
133	NC_011351	AT	4	8	5981	5988	50 %	50 %	0 %	0 %	209395648
134	NC_011351	GAT	2	6	6003	6008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395648
135	NC_011351	ATG	2	6	6052	6057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395648
136	NC_011351	ATT	2	6	6087	6092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395648
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277	NC_011351	TTAT	2	8	12160	12167	25 %	75 %	0 %	0 %	209395641
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398	NC_011351	CCT	2	6	18349	18354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209395643
399	NC_011351	TGCT	2	8	18355	18362	0 %	50 %	25 %	25 %	209395643
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401	NC_011351	TTG	2	6	18411	18416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395643
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